Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1QTNF1Q9BXJ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1QTNF1Q9BXJ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1QTNF1Q9BXJ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C1QTNF1Q9BXJ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.57■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C1QTNF1Q9BXJ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C1QTNF1Q9BXJ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1QTNF1Q9BXJ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms