Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ67

GRWD1, Glutamate-rich WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-9■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 CCDC12-204ENST00000460035 572 ntTSL 216.37■□□□□ 0.219e-8■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.182e-9■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 MYH10-206ENST00000465458 799 ntTSL 223.5■■□□□ 1.351e-8■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-208ENST00000489649 1621 ntTSL 520.44■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-209ENST00000494312 1961 ntTSL 219.5■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-206ENST00000467523 663 ntTSL 518.44■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-203ENST00000373944 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-204ENST00000395405 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 HNRNPD-211ENST00000514671 1089 ntTSL 516.23■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 HNRNPD-206ENST00000508119 735 ntTSL 214.23□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 HNRNPD-208ENST00000509263 782 ntTSL 512.7□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 HNRNPD-210ENST00000514325 4597 ntTSL 1 (best)6.41□□□□□ -1.381e-10■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 MYH9-211ENST00000495928 329 ntTSL 218.65■□□□□ 0.581e-12■■■■■ 28.2
GRWD1Q9BQ67 MORC2-206ENST00000476152 811 ntTSL 521.12■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 28.2
GRWD1Q9BQ67 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.995e-9■■■■■ 28.2
GRWD1Q9BQ67 LRRC45-204ENST00000582083 527 ntTSL 326.51■■□□□ 1.835e-7■■■■■ 28.2
GRWD1Q9BQ67 SUPT6H-210ENST00000584285 446 ntTSL 319.09■□□□□ 0.655e-8■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.984e-9■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.84e-9■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 210.42□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 RABGAP1-209ENST00000475607 564 ntTSL 415.95■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 RABGAP1-212ENST00000493854 575 ntTSL 410.73□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 ACLY-208ENST00000590735 586 ntTSL 423.98■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 ACLY-209ENST00000590770 583 ntTSL 419.08■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.064e-8■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.864e-8■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 PPFIBP1-205ENST00000535575 559 ntTSL 316.51■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 PPFIBP1-217ENST00000545381 1191 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 PPFIBP1-208ENST00000538433 609 ntTSL 311.78□□□□□ -0.524e-8■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 PPFIBP1-214ENST00000542187 585 ntTSL 39.03□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 EIF4E2-214ENST00000498242 1110 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 28.1
GRWD1Q9BQ67 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 226.1■■□□□ 1.772e-7■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -14e-7■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 26.03□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)5.84□□□□□ -1.484e-7■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.068e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 COPS6-207ENST00000472107 835 ntTSL 228.71■■■□□ 2.198e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 PSME3-212ENST00000591722 537 ntTSL 227.03■■□□□ 1.928e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 COPS6-205ENST00000465027 1171 ntTSL 1 (best)26.17■■□□□ 1.788e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 SEC14L1-222ENST00000588880 553 ntTSL 225.96■■□□□ 1.758e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.648e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 FAT1-208ENST00000509647 1852 ntTSL 1 (best)23.6■■□□□ 1.378e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 ZMYND11-211ENST00000439456 762 ntTSL 422.13■■□□□ 1.138e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCDC92-202ENST00000535556 555 ntTSL 421.01■□□□□ 0.958e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.638e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCDC92-206ENST00000544798 1654 ntTSL 318.12■□□□□ 0.498e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCDC92-204ENST00000539761 751 ntTSL 318.1■□□□□ 0.498e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 TOP1MT-211ENST00000520950 564 ntTSL 417.37■□□□□ 0.378e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.348e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 ZRANB3-209ENST00000495945 569 ntTSL 316.61■□□□□ 0.258e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.078e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 TPM3P9-202ENST00000492121 745 ntBASIC15.15■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 TACC2-223ENST00000503769 608 ntTSL 215□□□□□ -0.018e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 ZMYND11-206ENST00000397955 659 ntTSL 514.2□□□□□ -0.148e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 SEC14L1-220ENST00000588696 437 ntTSL 213.91□□□□□ -0.188e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CCDC92-205ENST00000542348 554 ntTSL 413.71□□□□□ -0.218e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 ZRANB3-204ENST00000412849 2572 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.378e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 MIA3-210ENST00000477519 401 ntTSL 29.85□□□□□ -0.838e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.128e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.426e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-204ENST00000446773 1496 ntTSL 1 (best)28.28■■■□□ 2.126e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.066e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-206ENST00000463794 445 ntTSL 325.5■■□□□ 1.676e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CNOT3-209ENST00000617930 2047 ntTSL 224.9■■□□□ 1.586e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-212ENST00000488383 1337 ntTSL 524.5■■□□□ 1.516e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.166e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-211ENST00000487873 464 ntTSL 320.94■□□□□ 0.946e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-208ENST00000467801 583 ntTSL 220.93■□□□□ 0.946e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-207ENST00000465699 692 ntTSL 318.88■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 HDGFL2-205ENST00000601353 648 ntTSL 518.71■□□□□ 0.596e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 LINC01021-203ENST00000510165 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.486e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 LINC01021-202ENST00000505775 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.386e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 C6orf136-209ENST00000468785 492 ntTSL 217.2■□□□□ 0.346e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 LINC01021-206ENST00000514844 667 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.326e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 MYOM3-203ENST00000448831 418 ntTSL 316.63■□□□□ 0.256e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 KIAA0319L-204ENST00000431916 912 ntTSL 315.86■□□□□ 0.136e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 CERK-204ENST00000471929 567 ntTSL 415.52■□□□□ 0.086e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 LINC01021-201ENST00000503107 458 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 MYO7A-206ENST00000467137 768 ntTSL 213.64□□□□□ -0.231e-10■■■■■ 28
GRWD1Q9BQ67 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 223.93■■□□□ 1.425e-9■■■■■ 27.9
GRWD1Q9BQ67 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.195e-9■■■■■ 27.9
GRWD1Q9BQ67 HSP90AA1-206ENST00000556554 552 ntTSL 217.84■□□□□ 0.457e-14■■■■■ 27.9
GRWD1Q9BQ67 SPCS3-203ENST00000507678 2655 ntTSL 230.48■■■□□ 2.472e-9■■■■■ 27.9
GRWD1Q9BQ67 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-9■■■■■ 27.9
GRWD1Q9BQ67 SRRT-209ENST00000474896 726 ntTSL 324.52■■□□□ 1.526e-9■■■■■ 27.9
GRWD1Q9BQ67 RRP1B-202ENST00000470886 4634 ntTSL 213.84□□□□□ -0.194e-9■■■■■ 27.9
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 27.8
GRWD1Q9BQ67 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 27.8
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