RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591722.5

PSME3-212, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene PSME3, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-212ENST00000591722 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.68■■■■■ 4.58
PSME3-212ENST00000591722 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.05■■■■□ 3.84
PSME3-212ENST00000591722 ABCC9O60706 1549 aa38.18■■■■□ 3.7
PSME3-212ENST00000591722 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.75■■■■□ 3.47
PSME3-212ENST00000591722 NACADO15069 1562 aa36.7■■■■□ 3.46
PSME3-212ENST00000591722 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.49■■■■□ 3.43
PSME3-212ENST00000591722 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
PSME3-212ENST00000591722 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.24■■■■□ 3.39
PSME3-212ENST00000591722 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.23■■■■□ 3.39
PSME3-212ENST00000591722 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.1■■■■□ 3.37
PSME3-212ENST00000591722 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.73■■■■□ 3.31
PSME3-212ENST00000591722 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.56■■■■□ 3.28
PSME3-212ENST00000591722 SCRIBQ14160 1630 aa35.43■■■■□ 3.26
PSME3-212ENST00000591722 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.35■■■■□ 3.25
PSME3-212ENST00000591722 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.29■■■■□ 3.24
PSME3-212ENST00000591722 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
PSME3-212ENST00000591722 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.66■■■■□ 3.14
PSME3-212ENST00000591722 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.38■■■■□ 3.09
PSME3-212ENST00000591722 SMARCA4P51532 1647 aa33.97■■■■□ 3.03
PSME3-212ENST00000591722 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
PSME3-212ENST00000591722 NCAPD3P42695 1498 aa33.84■■■■□ 3.01
PSME3-212ENST00000591722 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.8■■■■□ 3
PSME3-212ENST00000591722 SMARCA2P51531 1590 aa33.76■■■□□ 2.99
PSME3-212ENST00000591722 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.72■■■□□ 2.99
PSME3-212ENST00000591722 HMGXB3Q12766 1538 aa33.69■■■□□ 2.98
PSME3-212ENST00000591722 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.64■■■□□ 2.98
PSME3-212ENST00000591722 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
PSME3-212ENST00000591722 WIZO95785 1651 aa33.29■■■□□ 2.92
PSME3-212ENST00000591722 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
PSME3-212ENST00000591722 NESP48681 1621 aa33.02■■■□□ 2.88
PSME3-212ENST00000591722 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33■■■□□ 2.87
PSME3-212ENST00000591722 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
PSME3-212ENST00000591722 ERCC6Q03468 1493 aa32.88■■■□□ 2.85
PSME3-212ENST00000591722 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.77■■■□□ 2.84
PSME3-212ENST00000591722 CUX2O14529 1486 aa32.77■■■□□ 2.84
PSME3-212ENST00000591722 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.75■■■□□ 2.83
PSME3-212ENST00000591722 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
PSME3-212ENST00000591722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.68■■■□□ 2.82
PSME3-212ENST00000591722 CFTRP13569 1480 aa32.59■■■□□ 2.81
PSME3-212ENST00000591722 PRDM2Q13029 1718 aa32.5■■■□□ 2.79
PSME3-212ENST00000591722 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.49■■■□□ 2.79
PSME3-212ENST00000591722 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.39■■■□□ 2.78
PSME3-212ENST00000591722 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.39■■■□□ 2.78
PSME3-212ENST00000591722 WDR62O43379 1518 aa32.37■■■□□ 2.77
PSME3-212ENST00000591722 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.36■■■□□ 2.77
PSME3-212ENST00000591722 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
PSME3-212ENST00000591722 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.95■■■□□ 2.71
PSME3-212ENST00000591722 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
PSME3-212ENST00000591722 TOPBP1Q92547 1522 aa31.89■■■□□ 2.7
PSME3-212ENST00000591722 ABCC8Q09428 1581 aa31.88■■■□□ 2.69
PSME3-212ENST00000591722 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.85■■■□□ 2.69
PSME3-212ENST00000591722 IFT140Q96RY7 1462 aa31.72■■■□□ 2.67
PSME3-212ENST00000591722 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.65
PSME3-212ENST00000591722 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
PSME3-212ENST00000591722 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
PSME3-212ENST00000591722 CUX1P39880 1505 aa31.58■■■□□ 2.65
PSME3-212ENST00000591722 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
PSME3-212ENST00000591722 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.46■■■□□ 2.63
PSME3-212ENST00000591722 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.41■■■□□ 2.62
PSME3-212ENST00000591722 WDR97A6NE52 1622 aa31.41■■■□□ 2.62
PSME3-212ENST00000591722 SOGA1O94964 1423 aa31.39■■■□□ 2.62
PSME3-212ENST00000591722 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.615e-7■■■■□ 21.8
PSME3-212ENST00000591722 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.33■■■□□ 2.61
PSME3-212ENST00000591722 TOP2BQ02880 1626 aa31.28■■■□□ 2.6
PSME3-212ENST00000591722 SYNJ1O43426 1573 aa31.23■■■□□ 2.59
PSME3-212ENST00000591722 OSCARQ8IYS5 282 aa31.23■■■□□ 2.59
PSME3-212ENST00000591722 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.22■■■□□ 2.59
PSME3-212ENST00000591722 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
PSME3-212ENST00000591722 CHD1O14646 1710 aa31.21■■■□□ 2.59
PSME3-212ENST00000591722 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.2■■■□□ 2.59
PSME3-212ENST00000591722 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.15■■■□□ 2.58
PSME3-212ENST00000591722 PBRM1Q86U86 1689 aa31.13■■■□□ 2.57
PSME3-212ENST00000591722 GRIN2BQ13224 1484 aa31.09■■■□□ 2.57
PSME3-212ENST00000591722 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
PSME3-212ENST00000591722 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.07■■■□□ 2.56
PSME3-212ENST00000591722 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.06■■■□□ 2.56
PSME3-212ENST00000591722 SYNJ2O15056 1496 aa30.94■■■□□ 2.54
PSME3-212ENST00000591722 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.9■■■□□ 2.54
PSME3-212ENST00000591722 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.9■■■□□ 2.54
PSME3-212ENST00000591722 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.9■■■□□ 2.54
PSME3-212ENST00000591722 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.85■■■□□ 2.53
PSME3-212ENST00000591722 FBLN2P98095 1184 aa30.84■■■□□ 2.53
PSME3-212ENST00000591722 ARHGEF11O15085 1522 aa30.83■■■□□ 2.53
PSME3-212ENST00000591722 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.83■■■□□ 2.53
PSME3-212ENST00000591722 ADAMTS12P58397 1594 aa30.83■■■□□ 2.53
PSME3-212ENST00000591722 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
PSME3-212ENST00000591722 GRIN2AQ12879 1464 aa30.71■■■□□ 2.51
PSME3-212ENST00000591722 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.7■■■□□ 2.5
PSME3-212ENST00000591722 NUP160Q12769 1436 aa30.63■■■□□ 2.49
PSME3-212ENST00000591722 TRIM41Q8WV44 630 aa30.62■■■□□ 2.49
PSME3-212ENST00000591722 CEP170Q5SW79 1584 aa30.61■■■□□ 2.49
PSME3-212ENST00000591722 ARAP1Q96P48 1450 aa30.57■■■□□ 2.48
PSME3-212ENST00000591722 KIF27Q86VH2 1401 aa30.57■■■□□ 2.48
PSME3-212ENST00000591722 CUL7Q14999 1698 aa30.53■■■□□ 2.48
PSME3-212ENST00000591722 IGF1RP08069 1367 aa30.52■■■□□ 2.48
PSME3-212ENST00000591722 SHROOM2Q13796 1616 aa30.51■■■□□ 2.47
PSME3-212ENST00000591722 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.4■■■□□ 2.46
PSME3-212ENST00000591722 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.38■■■□□ 2.45
PSME3-212ENST00000591722 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.35■■■□□ 2.45
PSME3-212ENST00000591722 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.28■■■□□ 2.44
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