Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms