Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PITX2Q99697 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PITX2Q99697 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITX2Q99697 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX2Q99697 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms