Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHP1Q99653 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHP1Q99653 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHP1Q99653 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHP1Q99653 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms