Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALS2CR12Q96Q35 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALS2CR12Q96Q35 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms