Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CFAP57Q96MR6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP57Q96MR6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP57Q96MR6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP57Q96MR6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP57Q96MR6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP57Q96MR6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms