Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE2Q96MF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE2Q96MF7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSMCE2Q96MF7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE2Q96MF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms