Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
STAC3Q96MF2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
STAC3Q96MF2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
STAC3Q96MF2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
STAC3Q96MF2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
STAC3Q96MF2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STAC3Q96MF2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
STAC3Q96MF2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms