Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPNQ96H22 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPNQ96H22 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPNQ96H22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms