Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3CQ96E17 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3CQ96E17 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3CQ96E17 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1238.5 ms