Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms