Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFHD2Q96C19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFHD2Q96C19 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHD2Q96C19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD2Q96C19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFHD2Q96C19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms