Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
VWDEQ8N2E2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
VWDEQ8N2E2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
VWDEQ8N2E2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
VWDEQ8N2E2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
VWDEQ8N2E2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
VWDEQ8N2E2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
VWDEQ8N2E2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
VWDEQ8N2E2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
VWDEQ8N2E2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms