Protein–RNA interactions for Protein: Q86UN3

RTN4RL2, Reticulon-4 receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RL2Q86UN3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RL2Q86UN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RTN4RL2Q86UN3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTN4RL2Q86UN3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4RL2Q86UN3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms