Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPNS3Q6ZMD2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPNS3Q6ZMD2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS3Q6ZMD2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPNS3Q6ZMD2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms