Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN1Q6UXK5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN1Q6UXK5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRN1Q6UXK5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms