Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HRCT1Q6UXD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HRCT1Q6UXD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms