Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms