Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ALS2CLQ60I27 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ALS2CLQ60I27 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALS2CLQ60I27 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ALS2CLQ60I27 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALS2CLQ60I27 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ALS2CLQ60I27 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ALS2CLQ60I27 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ALS2CLQ60I27 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ALS2CLQ60I27 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ALS2CLQ60I27 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALS2CLQ60I27 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALS2CLQ60I27 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ALS2CLQ60I27 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ALS2CLQ60I27 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ALS2CLQ60I27 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ALS2CLQ60I27 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ALS2CLQ60I27 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ALS2CLQ60I27 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ALS2CLQ60I27 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ALS2CLQ60I27 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ALS2CLQ60I27 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ALS2CLQ60I27 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ALS2CLQ60I27 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ALS2CLQ60I27 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ALS2CLQ60I27 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ALS2CLQ60I27 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ALS2CLQ60I27 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ALS2CLQ60I27 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ALS2CLQ60I27 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2CLQ60I27 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ALS2CLQ60I27 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ALS2CLQ60I27 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ALS2CLQ60I27 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ALS2CLQ60I27 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ALS2CLQ60I27 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ALS2CLQ60I27 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ALS2CLQ60I27 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ALS2CLQ60I27 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2CLQ60I27 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ALS2CLQ60I27 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ALS2CLQ60I27 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2CLQ60I27 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ALS2CLQ60I27 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ALS2CLQ60I27 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ALS2CLQ60I27 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ALS2CLQ60I27 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ALS2CLQ60I27 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ALS2CLQ60I27 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ALS2CLQ60I27 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ALS2CLQ60I27 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ALS2CLQ60I27 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ALS2CLQ60I27 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ALS2CLQ60I27 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ALS2CLQ60I27 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALS2CLQ60I27 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALS2CLQ60I27 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ALS2CLQ60I27 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2CLQ60I27 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2CLQ60I27 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2CLQ60I27 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALS2CLQ60I27 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ALS2CLQ60I27 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2CLQ60I27 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ALS2CLQ60I27 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ALS2CLQ60I27 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ALS2CLQ60I27 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ALS2CLQ60I27 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALS2CLQ60I27 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALS2CLQ60I27 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALS2CLQ60I27 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ALS2CLQ60I27 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2CLQ60I27 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALS2CLQ60I27 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALS2CLQ60I27 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALS2CLQ60I27 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALS2CLQ60I27 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2CLQ60I27 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALS2CLQ60I27 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALS2CLQ60I27 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ALS2CLQ60I27 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2CLQ60I27 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2CLQ60I27 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2CLQ60I27 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2CLQ60I27 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2CLQ60I27 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2CLQ60I27 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2CLQ60I27 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALS2CLQ60I27 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALS2CLQ60I27 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALS2CLQ60I27 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALS2CLQ60I27 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2CLQ60I27 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2CLQ60I27 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALS2CLQ60I27 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2CLQ60I27 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2CLQ60I27 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALS2CLQ60I27 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALS2CLQ60I27 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms