Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NTRK3Q16288 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NTRK3Q16288 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NTRK3Q16288 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NTRK3Q16288 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NTRK3Q16288 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
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