Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNCBQ16143 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNCBQ16143 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNCBQ16143 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNCBQ16143 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNCBQ16143 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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