Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAE1Q13564 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAE1Q13564 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAE1Q13564 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAE1Q13564 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms