Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
NEUROD1Q13562 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NEUROD1Q13562 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
NEUROD1Q13562 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NEUROD1Q13562 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NEUROD1Q13562 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NEUROD1Q13562 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEUROD1Q13562 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
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