Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SSRP1Q08945 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSRP1Q08945 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SSRP1Q08945 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SSRP1Q08945 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SSRP1Q08945 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SSRP1Q08945 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms