Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1S2P56377 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP1S2P56377 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1S2P56377 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S2P56377 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1S2P56377 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1S2P56377 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1S2P56377 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1S2P56377 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1S2P56377 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AP1S2P56377 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms