Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VAMP7P51809 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAMP7P51809 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAMP7P51809 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAMP7P51809 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VAMP7P51809 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VAMP7P51809 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAMP7P51809 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAMP7P51809 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAMP7P51809 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAMP7P51809 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAMP7P51809 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms