Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOPP49908 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SELENOPP49908 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SELENOPP49908 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOPP49908 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELENOPP49908 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms