Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ZEB1P37275 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ZEB1P37275 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZEB1P37275 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZEB1P37275 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZEB1P37275 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZEB1P37275 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ZEB1P37275 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ZEB1P37275 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ZEB1P37275 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ZEB1P37275 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ZEB1P37275 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ZEB1P37275 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ZEB1P37275 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 565.3 ms