Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFRSF8P28908 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFRSF8P28908 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFRSF8P28908 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFRSF8P28908 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF8P28908 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF8P28908 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms