Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP6V1B2P21281 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP6V1B2P21281 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1B2P21281 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1B2P21281 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms