Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms