Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D1P20393 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR1D1P20393 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D1P20393 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D1P20393 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms