Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCN1P20061 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCN1P20061 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCN1P20061 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCN1P20061 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN1P20061 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN1P20061 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCN1P20061 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCN1P20061 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCN1P20061 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCN1P20061 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCN1P20061 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCN1P20061 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCN1P20061 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCN1P20061 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCN1P20061 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCN1P20061 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCN1P20061 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCN1P20061 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCN1P20061 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCN1P20061 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCN1P20061 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCN1P20061 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCN1P20061 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCN1P20061 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCN1P20061 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCN1P20061 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCN1P20061 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCN1P20061 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCN1P20061 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCN1P20061 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCN1P20061 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCN1P20061 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCN1P20061 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCN1P20061 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCN1P20061 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN1P20061 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN1P20061 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN1P20061 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCN1P20061 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCN1P20061 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCN1P20061 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCN1P20061 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCN1P20061 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCN1P20061 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCN1P20061 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCN1P20061 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCN1P20061 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCN1P20061 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCN1P20061 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCN1P20061 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCN1P20061 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCN1P20061 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCN1P20061 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCN1P20061 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCN1P20061 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCN1P20061 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCN1P20061 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCN1P20061 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCN1P20061 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCN1P20061 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCN1P20061 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCN1P20061 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCN1P20061 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCN1P20061 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCN1P20061 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCN1P20061 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCN1P20061 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCN1P20061 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCN1P20061 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCN1P20061 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
TCN1P20061 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCN1P20061 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCN1P20061 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCN1P20061 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCN1P20061 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCN1P20061 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCN1P20061 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCN1P20061 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCN1P20061 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCN1P20061 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCN1P20061 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCN1P20061 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCN1P20061 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCN1P20061 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCN1P20061 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCN1P20061 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCN1P20061 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCN1P20061 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCN1P20061 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCN1P20061 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCN1P20061 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCN1P20061 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCN1P20061 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCN1P20061 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCN1P20061 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCN1P20061 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCN1P20061 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCN1P20061 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCN1P20061 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms