Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESRRAP11474 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ESRRAP11474 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ESRRAP11474 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESRRAP11474 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ESRRAP11474 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESRRAP11474 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms