Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX5BP10606 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX5BP10606 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX5BP10606 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX5BP10606 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX5BP10606 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX5BP10606 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX5BP10606 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX5BP10606 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX5BP10606 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX5BP10606 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX5BP10606 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX5BP10606 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX5BP10606 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX5BP10606 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX5BP10606 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX5BP10606 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX5BP10606 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX5BP10606 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX5BP10606 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX5BP10606 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX5BP10606 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX5BP10606 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX5BP10606 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX5BP10606 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX5BP10606 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX5BP10606 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX5BP10606 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX5BP10606 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX5BP10606 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COX5BP10606 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX5BP10606 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX5BP10606 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX5BP10606 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX5BP10606 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX5BP10606 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX5BP10606 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX5BP10606 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COX5BP10606 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX5BP10606 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX5BP10606 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX5BP10606 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX5BP10606 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX5BP10606 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX5BP10606 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX5BP10606 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COX5BP10606 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX5BP10606 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX5BP10606 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX5BP10606 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX5BP10606 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX5BP10606 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX5BP10606 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX5BP10606 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX5BP10606 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX5BP10606 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX5BP10606 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX5BP10606 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX5BP10606 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX5BP10606 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX5BP10606 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX5BP10606 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX5BP10606 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COX5BP10606 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX5BP10606 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX5BP10606 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX5BP10606 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX5BP10606 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5BP10606 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5BP10606 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5BP10606 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5BP10606 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5BP10606 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5BP10606 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5BP10606 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5BP10606 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5BP10606 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5BP10606 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5BP10606 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5BP10606 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5BP10606 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5BP10606 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5BP10606 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5BP10606 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5BP10606 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5BP10606 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5BP10606 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5BP10606 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5BP10606 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5BP10606 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX5BP10606 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX5BP10606 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX5BP10606 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX5BP10606 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX5BP10606 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX5BP10606 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX5BP10606 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX5BP10606 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX5BP10606 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX5BP10606 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms