Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCBP10092 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCBP10092 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCBP10092 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCBP10092 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCBP10092 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCBP10092 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCBP10092 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCBP10092 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCBP10092 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCBP10092 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCBP10092 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCBP10092 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCBP10092 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCBP10092 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCBP10092 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCBP10092 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCBP10092 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCBP10092 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCBP10092 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCBP10092 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCBP10092 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCBP10092 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCBP10092 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCBP10092 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCBP10092 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCBP10092 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCBP10092 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCBP10092 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCBP10092 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCBP10092 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCBP10092 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCBP10092 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCBP10092 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCBP10092 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCBP10092 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCBP10092 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCBP10092 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCBP10092 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCBP10092 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCBP10092 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCBP10092 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCBP10092 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCBP10092 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCBP10092 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCBP10092 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCBP10092 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCBP10092 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCBP10092 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCBP10092 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCBP10092 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCBP10092 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCBP10092 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCBP10092 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCBP10092 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCBP10092 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCBP10092 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCBP10092 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCBP10092 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCBP10092 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCBP10092 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCBP10092 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCBP10092 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCBP10092 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCBP10092 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCBP10092 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCBP10092 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCBP10092 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCBP10092 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCBP10092 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCBP10092 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCBP10092 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCBP10092 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCBP10092 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCBP10092 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCBP10092 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCBP10092 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCBP10092 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCBP10092 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCBP10092 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCBP10092 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCBP10092 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCBP10092 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCBP10092 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCBP10092 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCBP10092 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCBP10092 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCBP10092 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCBP10092 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCBP10092 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCBP10092 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCBP10092 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCBP10092 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCBP10092 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCBP10092 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCBP10092 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCBP10092 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCBP10092 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCBP10092 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCBP10092 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms