Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRD1O95696 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRD1O95696 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
BRD1O95696 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
BRD1O95696 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRD1O95696 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRD1O95696 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
BRD1O95696 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRD1O95696 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRD1O95696 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRD1O95696 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRD1O95696 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRD1O95696 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRD1O95696 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
BRD1O95696 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRD1O95696 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRD1O95696 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRD1O95696 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRD1O95696 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRD1O95696 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRD1O95696 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRD1O95696 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRD1O95696 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRD1O95696 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRD1O95696 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRD1O95696 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRD1O95696 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
BRD1O95696 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRD1O95696 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRD1O95696 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRD1O95696 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRD1O95696 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRD1O95696 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRD1O95696 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRD1O95696 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRD1O95696 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRD1O95696 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRD1O95696 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRD1O95696 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BRD1O95696 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
BRD1O95696 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
BRD1O95696 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRD1O95696 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRD1O95696 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRD1O95696 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRD1O95696 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRD1O95696 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
BRD1O95696 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRD1O95696 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRD1O95696 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRD1O95696 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRD1O95696 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRD1O95696 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRD1O95696 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRD1O95696 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD1O95696 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD1O95696 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD1O95696 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD1O95696 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD1O95696 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD1O95696 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD1O95696 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD1O95696 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRD1O95696 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRD1O95696 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRD1O95696 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRD1O95696 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRD1O95696 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRD1O95696 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRD1O95696 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRD1O95696 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRD1O95696 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRD1O95696 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRD1O95696 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRD1O95696 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRD1O95696 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRD1O95696 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRD1O95696 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRD1O95696 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRD1O95696 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRD1O95696 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRD1O95696 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRD1O95696 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRD1O95696 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRD1O95696 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRD1O95696 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRD1O95696 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRD1O95696 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRD1O95696 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRD1O95696 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRD1O95696 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRD1O95696 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
BRD1O95696 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRD1O95696 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRD1O95696 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
BRD1O95696 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRD1O95696 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRD1O95696 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BRD1O95696 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BRD1O95696 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms