Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT33AO76009 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT33AO76009 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT33AO76009 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT33AO76009 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms