Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFYO75367 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFYO75367 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFYO75367 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFYO75367 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFYO75367 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms