Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMDSO60547 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMDSO60547 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMDSO60547 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMDSO60547 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMDSO60547 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMDSO60547 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMDSO60547 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMDSO60547 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMDSO60547 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMDSO60547 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMDSO60547 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMDSO60547 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMDSO60547 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMDSO60547 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMDSO60547 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMDSO60547 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMDSO60547 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMDSO60547 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMDSO60547 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMDSO60547 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMDSO60547 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMDSO60547 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMDSO60547 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMDSO60547 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GMDSO60547 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMDSO60547 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMDSO60547 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMDSO60547 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMDSO60547 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMDSO60547 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMDSO60547 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMDSO60547 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMDSO60547 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMDSO60547 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMDSO60547 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMDSO60547 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GMDSO60547 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMDSO60547 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMDSO60547 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMDSO60547 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMDSO60547 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMDSO60547 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMDSO60547 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMDSO60547 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMDSO60547 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMDSO60547 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GMDSO60547 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GMDSO60547 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMDSO60547 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMDSO60547 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMDSO60547 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMDSO60547 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMDSO60547 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMDSO60547 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMDSO60547 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMDSO60547 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMDSO60547 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMDSO60547 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMDSO60547 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMDSO60547 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMDSO60547 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMDSO60547 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMDSO60547 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMDSO60547 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMDSO60547 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMDSO60547 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMDSO60547 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMDSO60547 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMDSO60547 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMDSO60547 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMDSO60547 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMDSO60547 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GMDSO60547 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMDSO60547 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMDSO60547 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMDSO60547 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMDSO60547 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMDSO60547 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMDSO60547 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMDSO60547 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMDSO60547 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMDSO60547 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMDSO60547 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GMDSO60547 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMDSO60547 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GMDSO60547 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMDSO60547 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMDSO60547 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMDSO60547 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMDSO60547 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GMDSO60547 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMDSO60547 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMDSO60547 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMDSO60547 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMDSO60547 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMDSO60547 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMDSO60547 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMDSO60547 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMDSO60547 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.6 ms