Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX5O60225 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX5O60225 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX5O60225 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX5O60225 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX5O60225 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX5O60225 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX5O60225 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX5O60225 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX5O60225 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX5O60225 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX5O60225 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX5O60225 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX5O60225 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX5O60225 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX5O60225 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX5O60225 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX5O60225 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX5O60225 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX5O60225 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX5O60225 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX5O60225 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX5O60225 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX5O60225 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX5O60225 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX5O60225 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX5O60225 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX5O60225 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX5O60225 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX5O60225 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX5O60225 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX5O60225 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX5O60225 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX5O60225 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX5O60225 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX5O60225 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX5O60225 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX5O60225 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX5O60225 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX5O60225 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX5O60225 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX5O60225 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX5O60225 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX5O60225 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX5O60225 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX5O60225 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX5O60225 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX5O60225 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX5O60225 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX5O60225 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX5O60225 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX5O60225 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX5O60225 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX5O60225 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX5O60225 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSX5O60225 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSX5O60225 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX5O60225 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX5O60225 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX5O60225 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX5O60225 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX5O60225 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX5O60225 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX5O60225 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX5O60225 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX5O60225 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX5O60225 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX5O60225 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX5O60225 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX5O60225 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX5O60225 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX5O60225 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX5O60225 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX5O60225 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX5O60225 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX5O60225 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX5O60225 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX5O60225 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX5O60225 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX5O60225 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX5O60225 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSX5O60225 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX5O60225 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX5O60225 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX5O60225 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX5O60225 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX5O60225 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX5O60225 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX5O60225 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX5O60225 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX5O60225 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX5O60225 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX5O60225 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX5O60225 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX5O60225 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX5O60225 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX5O60225 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX5O60225 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX5O60225 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX5O60225 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms