Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCO2O43819 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCO2O43819 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCO2O43819 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCO2O43819 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCO2O43819 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCO2O43819 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCO2O43819 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCO2O43819 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCO2O43819 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCO2O43819 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCO2O43819 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCO2O43819 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCO2O43819 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCO2O43819 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCO2O43819 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCO2O43819 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCO2O43819 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCO2O43819 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCO2O43819 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCO2O43819 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCO2O43819 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCO2O43819 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCO2O43819 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCO2O43819 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCO2O43819 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCO2O43819 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCO2O43819 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCO2O43819 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCO2O43819 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCO2O43819 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCO2O43819 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCO2O43819 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCO2O43819 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCO2O43819 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCO2O43819 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCO2O43819 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCO2O43819 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCO2O43819 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCO2O43819 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCO2O43819 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCO2O43819 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCO2O43819 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCO2O43819 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCO2O43819 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCO2O43819 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCO2O43819 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCO2O43819 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCO2O43819 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCO2O43819 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCO2O43819 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCO2O43819 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCO2O43819 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCO2O43819 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCO2O43819 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCO2O43819 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCO2O43819 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCO2O43819 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCO2O43819 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCO2O43819 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCO2O43819 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCO2O43819 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCO2O43819 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCO2O43819 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCO2O43819 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCO2O43819 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCO2O43819 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCO2O43819 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCO2O43819 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCO2O43819 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCO2O43819 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCO2O43819 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCO2O43819 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCO2O43819 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCO2O43819 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCO2O43819 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCO2O43819 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCO2O43819 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCO2O43819 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCO2O43819 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCO2O43819 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCO2O43819 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCO2O43819 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCO2O43819 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCO2O43819 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCO2O43819 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCO2O43819 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCO2O43819 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCO2O43819 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCO2O43819 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCO2O43819 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCO2O43819 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCO2O43819 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCO2O43819 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCO2O43819 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCO2O43819 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCO2O43819 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCO2O43819 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCO2O43819 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCO2O43819 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms