Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TBX3O15119 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TBX3O15119 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBX3O15119 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBX3O15119 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBX3O15119 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBX3O15119 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBX3O15119 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBX3O15119 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBX3O15119 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TBX3O15119 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TBX3O15119 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TBX3O15119 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBX3O15119 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBX3O15119 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBX3O15119 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBX3O15119 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBX3O15119 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBX3O15119 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBX3O15119 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TBX3O15119 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TBX3O15119 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBX3O15119 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBX3O15119 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBX3O15119 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TBX3O15119 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBX3O15119 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBX3O15119 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBX3O15119 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TBX3O15119 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TBX3O15119 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TBX3O15119 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TBX3O15119 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TBX3O15119 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TBX3O15119 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TBX3O15119 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBX3O15119 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBX3O15119 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBX3O15119 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBX3O15119 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TBX3O15119 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TBX3O15119 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TBX3O15119 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TBX3O15119 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TBX3O15119 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TBX3O15119 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TBX3O15119 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBX3O15119 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBX3O15119 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBX3O15119 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TBX3O15119 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBX3O15119 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TBX3O15119 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TBX3O15119 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TBX3O15119 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TBX3O15119 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TBX3O15119 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBX3O15119 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBX3O15119 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TBX3O15119 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TBX3O15119 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TBX3O15119 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TBX3O15119 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TBX3O15119 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TBX3O15119 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TBX3O15119 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TBX3O15119 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TBX3O15119 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TBX3O15119 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TBX3O15119 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TBX3O15119 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TBX3O15119 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TBX3O15119 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TBX3O15119 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TBX3O15119 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TBX3O15119 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TBX3O15119 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TBX3O15119 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TBX3O15119 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TBX3O15119 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TBX3O15119 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TBX3O15119 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TBX3O15119 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TBX3O15119 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TBX3O15119 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TBX3O15119 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TBX3O15119 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TBX3O15119 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TBX3O15119 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TBX3O15119 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TBX3O15119 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TBX3O15119 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TBX3O15119 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TBX3O15119 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TBX3O15119 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TBX3O15119 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TBX3O15119 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TBX3O15119 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TBX3O15119 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TBX3O15119 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms