Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SETD1AO15047 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETD1AO15047 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SETD1AO15047 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETD1AO15047 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SETD1AO15047 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETD1AO15047 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SETD1AO15047 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SETD1AO15047 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SETD1AO15047 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SETD1AO15047 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms