Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAD1O00515 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAD1O00515 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAD1O00515 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAD1O00515 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAD1O00515 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAD1O00515 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LAD1O00515 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAD1O00515 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAD1O00515 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LAD1O00515 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAD1O00515 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAD1O00515 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LAD1O00515 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAD1O00515 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAD1O00515 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAD1O00515 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAD1O00515 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAD1O00515 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAD1O00515 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAD1O00515 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAD1O00515 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAD1O00515 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAD1O00515 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAD1O00515 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAD1O00515 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAD1O00515 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAD1O00515 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAD1O00515 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAD1O00515 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAD1O00515 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAD1O00515 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAD1O00515 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAD1O00515 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAD1O00515 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAD1O00515 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAD1O00515 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAD1O00515 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAD1O00515 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAD1O00515 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAD1O00515 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAD1O00515 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAD1O00515 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAD1O00515 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAD1O00515 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAD1O00515 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAD1O00515 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAD1O00515 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAD1O00515 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAD1O00515 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAD1O00515 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAD1O00515 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAD1O00515 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAD1O00515 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAD1O00515 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAD1O00515 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAD1O00515 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAD1O00515 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAD1O00515 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAD1O00515 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAD1O00515 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAD1O00515 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAD1O00515 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAD1O00515 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LAD1O00515 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAD1O00515 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAD1O00515 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAD1O00515 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAD1O00515 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LAD1O00515 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAD1O00515 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAD1O00515 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAD1O00515 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAD1O00515 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAD1O00515 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAD1O00515 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LAD1O00515 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAD1O00515 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAD1O00515 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAD1O00515 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAD1O00515 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAD1O00515 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LAD1O00515 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAD1O00515 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAD1O00515 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAD1O00515 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAD1O00515 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAD1O00515 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAD1O00515 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAD1O00515 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAD1O00515 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms