Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
H3BQV1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
H3BQV1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
H3BQV1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
H3BQV1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
H3BQV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
H3BQV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
H3BQV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
H3BQV1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
H3BQV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
H3BQV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
H3BQV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
H3BQV1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
H3BQV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
H3BQV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
H3BQV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
H3BQV1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
H3BQV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
H3BQV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
H3BQV1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
H3BQV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
H3BQV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
H3BQV1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
H3BQV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
H3BQV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
H3BQV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
H3BQV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
H3BQV1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
H3BQV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
H3BQV1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
H3BQV1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
H3BQV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
H3BQV1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
H3BQV1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
H3BQV1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
H3BQV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
H3BQV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
H3BQV1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
H3BQV1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
H3BQV1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
H3BQV1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
H3BQV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H3BQV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H3BQV1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
H3BQV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H3BQV1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H3BQV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H3BQV1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
H3BQV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
H3BQV1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
H3BQV1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
H3BQV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
H3BQV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
H3BQV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
H3BQV1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
H3BQV1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
H3BQV1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H3BQV1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H3BQV1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H3BQV1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H3BQV1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H3BQV1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
H3BQV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
H3BQV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H3BQV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
H3BQV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H3BQV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
H3BQV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
H3BQV1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
H3BQV1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
H3BQV1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
H3BQV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
H3BQV1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
H3BQV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
H3BQV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
H3BQV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
H3BQV1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
H3BQV1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
H3BQV1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
H3BQV1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H3BQV1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
H3BQV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H3BQV1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
H3BQV1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H3BQV1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H3BQV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BQV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BQV1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BQV1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BQV1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BQV1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BQV1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H3BQV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H3BQV1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H3BQV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H3BQV1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H3BQV1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H3BQV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H3BQV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H3BQV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms