Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCRIP1C9JLW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCRIP1C9JLW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCRIP1C9JLW8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MCRIP1C9JLW8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms