Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF233A6NK53 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF233A6NK53 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF233A6NK53 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF233A6NK53 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF233A6NK53 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms