Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P1A6NDR6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3P1A6NDR6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEIS3P1A6NDR6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEIS3P1A6NDR6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms